A potopna vodna črpalka črpa vodo iz določene globine znotraj ribnika ali vodnjaka. Globina potopitve potopna vodna črpalka neposredno vpliva na pretok izhodne črpalke. Namestitev potopna črpalka za čisto vodo preblizu vodne gladine vnese zrak v dovod. Zračni mehurčki, ki vstopajo v potopna namakalna črpalka zmanjšajo učinkovitost črpalke za do 40 odstotkov. A potopna črpalka za fontano zahteva minimalno potopitev 30 centimetrov, da se prepreči nastanek vrtinca. A potopna drenažna črpalka Delo v plitvih lužah zahteva skrbno namestitev, da se prepreči vdor zraka.
Idealna globina potopitve za potopna vodna črpalka odvisno od velikosti črpalke in zasnove sesalnega kanala. Majhen potopna vrtna črpalka z dovodom na dnu deluje dobro 40 centimetrov pod površino. Velik potopna komunalna črpalka s stranskim dovodom potrebuje vsaj 60 centimetrov vode nad ohišjem črpalke. Testiranje različnih globin za potopna vodna črpalka razkrije idealno točko za maksimalen pretok. Premikanje potopna namakalna črpalka 10 centimetrov globlje lahko poveča produktivnost za 15 odstotkov. potopna črpalka za slap pregloboko postavljena, doda nepotreben pritisk na glavo zaradi vodnega stolpca.
Nastanek vrtinca se pojavi, ko potopna vodna črpalka prehitro črpa vodo iz plitvega vira. Vrtinec vleče zrak s površine navzdol v rotor potopna črpalka za čisto vodoZrak v rotorju povzroča kavitacijo, ki poškoduje lopatice potopna vodna črpalkaUporaba plavajočega sesalnega zaslona ali pregradne plošče okoli potopna vrtna črpalka preprečuje nastanek vrtinca. A potopna črpalka za fontano s posebej zasnovanim dovodom v obliki zvona zmanjšuje tveganje vrtinca. Upravljavec potopna vodna črpalka opazovati bi morali vodno gladino glede vzorcev vrtenja.
Motnje sedimentov so še ena skrb pri postavljanju potopna vodna črpalkaPostavitev potopna namakalna črpalka neposredno na blatnem dnu dvigne drobne delce. A potopna črpalka za čisto vodo Dvigovanje blatne vode tvega zamašitev rotorja in obrabo tesnila. Vzmetenje potopna vodna črpalka 15 centimetrov nad dnom ohranja dovod v čisti vodi. A potopna drenažna črpalka uporablja se za odvajanje čiste vode, mora stati na ravni deski, da se prepreči usedlina. potopna komunalna črpalka pri dvignjenem stojalu se ta razmik samodejno vključi.
Sezonske spremembe gladine vode vplivajo na postavitev potopna vodna črpalka. A potopna vrtna črpalka nameščena na srednji globini spomladi, lahko postane preveč plitva v poletni suši. Spremljanje gladine vode lastniku omogoča potopna vodna črpalka tedensko prilagajanje globine potopitve. Spuščanje potopna črpalka za fontano Ko se gladina ribnika znižuje, se ohranja varna meja potopitve. potopna namakalna črpalka Črpalka ne sme nikoli delovati, če je nad ohišjem manj kot 20 centimetrov vode. Pravilna globina potopitve zagotavlja potopna vodna črpalka zagotavlja nazivni pretok in preprečuje prezgodnjo okvaro.